MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 chromosome

Total Repeats: 17507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015703	CT	3	6	75	80	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015703	T	6	6	96	101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015703	TCA	2	6	1551	1556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015703	T	8	8	3116	3123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015703	TAT	2	6	3146	3151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015703	ATC	2	6	3185	3190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015703	TTCC	2	8	5797	5804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015703	CTC	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_015703	TTC	2	6	10550	10555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015703	TTCC	2	8	12445	12452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015703	CAA	2	6	12454	12459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015703	GAAA	2	8	12475	12482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015703	AACTA	2	10	12494	12503	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015703	T	7	7	12504	12510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015703	GAC	2	6	12514	12519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015703	AAT	2	6	12565	12570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015703	A	6	6	12610	12615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015703	TGC	2	6	12786	12791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015703	GAA	2	6	12827	12832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015703	TCG	2	6	12840	12845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015703	CAT	2	6	12905	12910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015703	CAA	2	6	12925	12930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015703	TA	3	6	13016	13021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015703	A	6	6	13021	13026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015703	A	6	6	13055	13060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015703	TTG	2	6	13310	13315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015703	T	6	6	16528	16533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015703	GTG	2	6	16534	16539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015703	T	6	6	16588	16593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015703	CAC	2	6	16603	16608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015703	ATTT	2	8	16680	16687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015703	T	8	8	16692	16699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015703	TAA	2	6	16741	16746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015703	CAT	2	6	16754	16759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015703	CAAC	2	8	18103	18110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015703	GCG	2	6	18115	18120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015703	TTG	2	6	19292	19297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015703	T	9	9	21569	21577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015703	GCA	2	6	21679	21684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015703	CGA	2	6	21708	21713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015703	T	6	6	21747	21752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015703	CGGG	2	8	21764	21771	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015703	CTG	2	6	21772	21777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015703	CAG	3	9	21869	21877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015703	CGA	2	6	21900	21905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015703	ACT	2	6	21921	21926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015703	TTAC	2	8	21988	21995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015703	T	6	6	21997	22002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015703	TGGTGT	2	12	22013	22024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015703	CCA	2	6	22029	22034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015703	AAATA	2	10	23461	23470	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015703	TAT	2	6	23471	23476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015703	TTG	2	6	23577	23582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015703	GTT	2	6	23595	23600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015703	CCA	2	6	23610	23615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_015703	GAG	2	6	24550	24555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015703	CTC	2	6	25586	25591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015703	TTTA	2	8	28472	28479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015703	GAG	2	6	29535	29540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015703	AGT	2	6	29557	29562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015703	ACT	2	6	29591	29596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015703	A	6	6	29620	29625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015703	TCCA	2	8	29631	29638	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015703	T	6	6	29655	29660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015703	TCA	2	6	32108	32113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015703	A	6	6	32928	32933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015703	TGA	2	6	32935	32940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015703	GGT	2	6	32952	32957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015703	CAC	2	6	33027	33032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015703	CT	3	6	33610	33615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015703	T	6	6	33642	33647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015703	AAT	2	6	33680	33685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015703	T	7	7	33693	33699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015703	GT	3	6	33701	33706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015703	GAA	2	6	33727	33732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015703	TTGG	2	8	33775	33782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015703	TAT	2	6	33798	33803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015703	T	6	6	35755	35760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015703	T	6	6	35765	35770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015703	A	6	6	35787	35792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015703	AGC	2	6	35821	35826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015703	TTC	2	6	38016	38021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015703	ATT	2	6	38072	38077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015703	CTT	2	6	38087	38092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015703	T	7	7	38106	38112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015703	GTG	2	6	38113	38118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015703	CAG	2	6	38137	38142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015703	AG	3	6	38633	38638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015703	ATTG	2	8	38657	38664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015703	AC	3	6	38680	38685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015703	TCG	2	6	38704	38709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015703	GAAT	2	8	41086	41093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015703	T	6	6	41112	41117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015703	ATC	2	6	42503	42508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015703	ATCA	2	8	42527	42534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015703	TGT	2	6	44088	44093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015703	AAT	2	6	44095	44100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015703	ATA	2	6	48744	48749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015703	ACA	2	6	48815	48820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015703	A	6	6	48820	48825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015703	CCAA	2	8	48826	48833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015703	GCG	2	6	49979	49984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015703	A	7	7	50009	50015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015703	T	7	7	51217	51223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015703	AAG	2	6	51278	51283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015703	AAC	2	6	51290	51295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015703	TTGGA	2	10	51334	51343	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015703	AAGT	2	8	51357	51364	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015703	AAT	2	6	51395	51400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015703	T	6	6	52909	52914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015703	T	6	6	52969	52974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015703	TGG	2	6	53046	53051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015703	CAC	2	6	53059	53064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015703	TTTGCA	2	12	53111	53122	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015703	AAC	2	6	53144	53149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015703	AT	3	6	53157	53162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015703	CAAAG	2	10	53171	53180	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015703	GCG	2	6	53325	53330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015703	AACC	2	8	53368	53375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015703	A	6	6	53406	53411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015703	GAGG	2	8	53412	53419	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015703	GGA	2	6	53475	53480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015703	CTG	2	6	53535	53540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015703	T	6	6	53570	53575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015703	CCA	2	6	53593	53598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015703	TGAT	3	12	53713	53724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015703	T	8	8	53726	53733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015703	TAT	2	6	53769	53774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015703	CT	3	6	53806	53811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015703	AAC	2	6	53823	53828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015703	ATTT	2	8	55186	55193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015703	TCGC	2	8	55284	55291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015703	GAC	2	6	55303	55308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015703	TAT	2	6	55309	55314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015703	GCC	2	6	55318	55323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_015703	GCC	2	6	55378	55383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_015703	TCCC	2	8	55418	55425	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_015703	TCCC	2	8	55435	55442	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
139	NC_015703	GTA	2	6	55469	55474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015703	ATGA	2	8	57731	57738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015703	TAA	2	6	60086	60091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015703	TTC	2	6	61605	61610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015703	AGAAC	2	10	61621	61630	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015703	AAAT	2	8	62880	62887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015703	T	6	6	64211	64216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015703	TGG	2	6	64234	64239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015703	A	6	6	64276	64281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015703	CAA	2	6	66027	66032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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423	NC_015703	AAT	2	6	196185	196190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_015703	A	8	8	196358	196365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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